奥运期间，全市未发生重大传染病暴发或流行，散发和新传入传染病病例得到及时控制，没有续发。8月1日至8月18日，全市报告肠道传染病比去年同期下降58.28%。这是自2004年全国建立传染病监测网络报告以来本市传染病控制最好的一年。
这一切得益于奥运赛事期间，本市卫生系统启用症状、关联性病例、肠道门诊监测和系统，并与铁路、民航、出入境及北方七省(区、市)卫生部门密切合作，实行了每日疫情通报制度。
针对奥运的公共卫生风险，本市建立和完善了13个监测系统，构建了敏锐的、严密的北京市奥运保障传染病监控防线。
全市667家医疗机构开展国家法定的38种传染病监测报告以及不明原因肺炎、传染性非典型肺炎、人感染高致病性禽流感等23个重点传染病专项监测系统。
4月1日起在全市335家肠道门诊监测点实行重点监测，早期预警。
对奥运场馆内197个医疗站点及本市125家二级以上医疗机构，对腹泻、发热、黄疸、皮疹及结膜红肿五种开展早期症状监测。
5月15日起对北京市6个区244所中小学校开展中小学生缺勤传染病早期预警监测。
广大公众可以通过12320公益电话对可疑传染病情况进行举报，做到传染病疫情早发现。
建立并实施与天津市、河北省、山东省、辽宁省、吉林省、山西省和内蒙古自治区及奥运举办城市的疾控部门重大传染病、公共卫生联防联控机制。建立信息定期通报制度，在奥运赛事期间实行重大疫情和突发共公共卫生事件即时通报，建立对密切接触者的协查机制，建立对流动人员的健康和排查制度，实施应急处置队伍及物资的联防联动。
建立并实施与铁路、交通、检验检疫、民航等部门密切配合，建立联络人对接机制，做好传染病境外传入和通过交通工具传播工作，加强传染病的排查工作。
奥运期间，5例境外传入性传染病例均由症症状监测系统及时发现，包括今年以来本市报告的首例传入性登革热病例。
预防为主，积极开展健康教育宣传。早在2007年副市长丁向阳就提出预防疾病，健康教育要走在前列；市卫生局党组书记金大鹏也提出了健康教育是最好“疫苗”的先进理念。北京市近年来不断加大健康教育工作力度，仅今年7月20日至8月18日，全市已累计发放宣传品1223766册，涉及种类2808种。健康教育、健康促进工作的不断深入对于提高市民对疾病的自我防范意识起到了极大的推动作用。