第一章 总 则
第一条 为了贯彻“经济建设必须依靠科学技术，科学技术必须面向经济建设”的战略方针，进一步调动科研人员积极性，发挥科研单位的活力和动力，缩短科研成果周期，多出成果、多出人才，多出经济社会效益，必须有计划、有步骤地改革现行科研经费管理办法。
科研基金对搞活科学劳动结构，大力扶植新学科，促进科学技术发展有着积极作用。卫生部决定从１９８５年起试行科研基金制。
第二条 根据中央提出的改革精神，结合我们既往工作实践，参阅国外科学基金的资料，卫生部医药卫生科研基金的基本作法是：计划指导（招标指南），自由申请；自愿组合，鼓励协作；提倡竞争，同行评议，择优支持；按课题拨款，专款专用；申请者负责，单位监督保证。要有利于调动科研人员的积极性、主动性、创 造性。
第三条 医药卫生科研基金用于支持《卫生部医药卫生科研招标指南》范围内的中标课题，包括基础、应用和开发研究。
第四条 科研基金资助的课题，按不同性质和偿还能力，实行无偿和部分偿还二种拨款办法。无偿拨款又分为签定合同和资助二种形式。基础研究采用资助拨款，应用研究采用无偿合同拨款，开发研究采用有偿合同拨款。
第五条 承担科研基金资助课题的单位，对外实行合同制，对内实行课题承包制，责、权、利相结合。
第六条 科研基金来源：国家科委拨给的科技三项补助经费，卫生事业费，个人捐赠的经费以及其他来源等。 科研基金按基础研究课题２０—２５％，应用研究课题６０—７０％，开发研 究课题１０—１５％的比例分配。
第二章 基金使用办法
第七条 资助科研基金数额与课题均需经同行专家评议，由卫生部最后审定拨款。
第八条 有偿合同课题的科研基金需经甲乙双方对任务指标、研究进度、完成期限、偿还经费额数、偿还期限等充分协商取得一致意见后，明确具体地填写在合同书上，甲乙双方签名并盖单位图章。
第九条 承担中标课题单位要对科研基金资助的课题加强领导、督促、检查，在人力、物力、时间上给予支持和保证。对课题经费，财务部门要独立核算，专款专用。
第十条 卫生部将采取各种方式组织有关专家及人员对课题进度和基金使用情况进行检查，如不按协约进度或资金使用不当等情况，将根据具体情节采取相应措施，追究责任，直至停止资助。
第十一条 科研基金，年终结余经费可跨年度使用，课题全部结束后剩余经费可留原单位使用。
第三章 合同的签定
第十二条 科研基金有偿合同的签定，卫生部为甲方，承担任务单位为乙方，承担任务单位的主管领导部门为丙方。甲乙双方签订合同。丙方对课题的进度和经费使用起保证、检查、监督作用。
第十三条 有几个单位协作的中标课题，由牵头单位与卫生部签定合同，划定经费。牵头单位与协作单位协商，划分经费。
第十四条 中标课题需作调整时，必须经甲方同意后方可调整，中标课题的经费全部收回或部分收回。
第十五条 科研基金专款专用，在保证完成好合同规定的任务前提下，科研经费节约归本单位。节约部分用于发展科研工作，改善科研条件，完成任务出色的经上级单位领导批准，可以提取部分经费按贡献大小奖励个人。
第四章 附 则
第十六条 本条例从颁发之日起开始试行。